林正刚认为，中国信息化存在的另外一个重大挑战是信息孤岛。所谓信息孤岛是指，在一个单位的各个部门之间由于种种原因造成部门与部门之间完全孤立，各种信息(如财务信息、各种计划信息等)无法或者无法顺畅地在部门与部门之间流动，这样就会形成信息孤岛。信息孤岛的存在不仅仅是在企业内部，在政府和城市的各个部门之间，往往由于网络的不相同属，也难以进行数据交换，从而形成彼此独立的信息孤岛，难以实现更高层次的信息处理。例如城市的交通部门与能源、市政等的信息系统都是彼此独立的。

　　不仅仅是在中国，在全球范围内信息孤岛都是信息化的老大难问题。由于网络孤岛的存在导致了应用孤岛，从而难以集成和统一管理，新应用部署和新应用系统难以实行。信息孤岛还会导致重复的基础架构投资，分散的用户数据库与基础平台也难以充分发挥信息化的巨大力量。

　　林正刚认为，信息化并不是技术问题，而是管理问题。信息孤岛源自管理孤岛，突破管理孤岛需要企业最高层的领导力，信息化条件下的领导力范围已经大大拓展。林正刚说，一个设计师如果要设计好一个伟大的城市，需要有艺术眼光，设计师很清楚自己手上有什么材料，把这些所有的材料特性都发挥出来，加上艺术眼光，才能造出伟大的楼，或者是一个城市。如果所有的设计师，都能够将IT作为一个建材来考量，信息化才会真正开始。而现在的楼房乃至城市的设计，都把IT系统的建设放在了最后。有调查数据表明，如果一个楼、一个建筑物从第一天开始通过IT的理念去设计、建设，成本会比传统的建筑成本要低，在节能方面会达到10%，甚至更高。

　　思科有个智能城市的计划，通过网络技术、传感器技术、绿色技术、节能技术等，能够让城市的交通、建筑、医疗、能源消耗实现更大程度的智能化，能够帮助政府实现持续发展。思科认为一个500万人口的城市，通过城市智能化的方法可增加收入150亿美元，20年内GDP实现50%增长，提供新的就业岗位20万个。

　　所以，林正刚说，今天的市场是高度的转型，我认为信息化第一个波浪刚刚开始，我们要解决两个问题：就是宽带和整合。